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jueves, 13 de diciembre de 2018


Los ecosistemas profundos de la Tierra (y otros planetas)

Los colaboradores del Observatorio Deep Carbon, que exploran las "Galápagos de las profundidades", se suman a lo que se sabe y se desconoce acerca del ecosistema más prístino de la Tierra.
Las bacterias, las arqueas y otros microbios, existen incluso en el subsuelo más profundo conocido, y son más extraños que sus homólogos de superficie.

Aproximadamente 70% de las bacterias y arqueas de la Tierra viven bajo tierra
La vida profunda de la Tierra sugiere que los microbios podrían habitar el subsuelo de otros planetas
Las bacterias  que apenas manifiestan algún tipo de metabolismo (algo así como las bacterias "zombies") y otras formas de vida análogas constituyen una inmensa cantidad de carbono contenido en las moléculas orgánicas en las profundidades del subsuelo de la Tierra.
En la víspera de la reunión anual de la American Geophysical Union, los científicos del Deep Carbon Observatory informaron hoy sobre varios descubrimientos transformadores, entre ellos, la cantidad y el tipo de vida que existe en el subsuelo profundo, bajo los extremos más extremos de presión, temperatura y con un consumo de energía y nutrientes extremadamente bajos.
Perforando 2.5 kilómetros en el fondo marino, y muestreando microbios de minas continentales y pozos de más de 5 km de profundidad, el equipo de investigadores ha utilizado los resultados para construir modelos del ecosistema en las profundidades del planeta.
Con información obtenida a partir de cientos de sitios bajo los continentes y los mares, han evaluado que el tamaño de la biosfera profunda es de 2 a 2.3 billones de kilómetros cúbicos (casi el doble del volumen de todos los océanos), así como la masa de carbono de la vida profunda podría alcanzar de: 15 a 23 [1] mil millones de toneladas (un promedio de al menos 7.5 toneladas de carbono por cu km km).
El trabajo también ayudó a determinar los tipos de entornos que en otros planetas o asteroides podrían sustentar la vida.
Entre muchos descubrimientos e ideas clave se señalan lo siguientes:
La biosfera profunda constituye un mundo que se puede ver como una especie de "Galápagos subterráneos" e incluye miembros de los tres dominios de la vida: bacterias y arqueas (microbios sin núcleo con membrana) y eucariotas (microbios o organismos multicelulares con células). que contienen un núcleo así como organelos unidos a la membrana)
Dos tipos de microbios, bacterias y arqueas, dominan la Tierra Profunda. Entre ellos hay millones de tipos distintos, la mayoría aún por descubrir o caracterizar. Esta llamada "materia oscura" microbiana expande dramáticamente nuestra perspectiva sobre el árbol de la vida. Los científicos de Deep Life dicen que alrededor del 70% de las bacterias y arqueas de la Tierra viven en el subsuelo
Los microbios profundos a menudo son muy diferentes de sus primos de superficie, con ciclos de vida en escalas de tiempo casi geológicas, que en algunos casos comen solo con energía de las rocas.
La diversidad genética de la vida debajo de la superficie es comparable o superior a la superficie
Si bien las comunidades microbianas subsuperficiales difieren mucho entre entornos, ciertos géneros y grupos taxonómicos superiores son ubicuos: aparecen en todo el planeta
La riqueza de la comunidad microbiana se relaciona con la edad de los sedimentos marinos donde se encuentran las células, lo que sugiere que en los sedimentos más antiguos, la energía de los alimentos ha disminuido con el tiempo, lo que reduce la comunidad microbiana
Los límites absolutos de la vida en la Tierra en términos de temperatura, presión y disponibilidad de energía aún no se han encontrado. Los registros se rompen continuamente. Un pionero para el organismo más caliente de la Tierra en el mundo natural es Geogemma barossii, un organismo unicelular que prospera en las fuentes hidrotermales en el fondo marino. Sus células, pequeñas esferas microscópicas, crecen y se replican a 121 grados centígrados (21 grados más que el punto de ebullición del agua)
La vida microbiana puede sobrevivir hasta 122 ° C, el récord alcanzado en una cultura de laboratorio (en comparación, el lugar más cálido de la superficie de la Tierra en un desierto iraní deshabitado, es de aproximadamente 71 ° C, la temperatura de un filete bien hecho) )
La profundidad récord a la que se ha encontrado vida en el subsuelo continental es de aproximadamente 5 km; el récord en aguas marinas es de 10,5 km desde la superficie del océano, una profundidad de presión extrema; a 4000 metros de profundidad, por ejemplo, la presión es aproximadamente 400 veces mayor que a nivel del mar
Los científicos tienen una mejor comprensión del impacto en la vida en las ubicaciones subsuperficiales manipuladas por los humanos (por ejemplo, lutitas fracturadas, captura y almacenamiento de carbono)
La precisión cada vez mayor y el costo decreciente de la secuenciación de ADN, junto con los avances en las tecnologías de perforación en aguas profundas (pionero en el buque científico japonés Chikyu, diseñado para perforar en el fondo en algunas de las regiones más sísmicamente activas del planeta) lo lograron Es posible que los investigadores vean por primera vez la composición de la biosfera profunda.
Existen esfuerzos comparables para perforar cada vez más profundamente en ambientes continentales, utilizando dispositivos de muestreo que mantienen la presión para preservar la vida microbiana (ninguno de los cuales se cree que represente una amenaza o beneficio para la salud humana).
Para estimar la masa total de la vida profunda subcontinental de la Tierra, por ejemplo, el equipo compiló datos sobre la concentración de células y la diversidad microbiana de lugares de todo el mundo.
Dirigidos por Cara Magnabosco del Centro de Biología Computacional del Instituto Flatiron, Nueva York, los científicos analizaron una serie de consideraciones, que incluyen el flujo de calor global, la temperatura de la superficie, la profundidad y la litología (las características físicas de las rocas en cada ubicación) para estimar que subsuelo continental alberga 2 a 6 × 1029 celdas.
Combinado con las estimaciones de la vida del subsuelo debajo de los océanos, la biomasa global total de la Tierra profunda es de aproximadamente 15 a 23 petagramos (15 a 23 mil millones de toneladas) de carbono.
Dice Mitch Sogin, del Laboratorio de Biología Marina, Woods Hole, EE. UU., Copresidente de la comunidad Deep Life de DCO con más de 300 investigadores en 34 países: "Explorar el subsuelo profundo es similar a explorar la selva amazónica. Hay vida en todas partes, y en todas partes hay una abundancia impresionante de organismos inesperados e inusuales.
"Los estudios moleculares aumentan la probabilidad de que la materia oscura microbiana sea mucho más diversa de lo que sabemos actualmente, y los linajes de ramificación más profundos desafían el concepto de tres dominios introducido por Carl Woese en 1977. Tal vez nos estamos acercando a un nexo donde los primeros los posibles patrones de ramificación podrían ser accesibles a través de una investigación profunda de la vida ".
"Hace diez años, sabíamos mucho menos sobre las fisiologías de las bacterias y microbios que dominan la biosfera del subsuelo", dice Karen Lloyd, de la Universidad de Tennessee en Knoxville, EE. UU. “Hoy, sabemos que, en muchos lugares, invierten la mayor parte de su energía simplemente en mantener su existencia y poco en crecer, lo cual es una forma fascinante de vivir.
“Hoy también, sabemos que la vida subsuperficial es común. Diez años atrás, solo habíamos probado algunos sitios, el tipo de lugares en los que esperaríamos encontrar vida. Ahora, gracias al muestreo ultra profundo, sabemos que podemos encontrarlos en casi todas partes, aunque el muestreo obviamente ha alcanzado solo una parte infinitesimalmente pequeña de la biosfera profunda ".
"Nuestros estudios de microbios de biosfera profundos han producido mucho conocimiento nuevo, pero también una realización y una apreciación mucho mayor de lo mucho que todavía tenemos que aprender sobre la vida del subsuelo", dice Rick Colwell, Universidad Estatal de Oregón, EE. UU. “Por ejemplo, los científicos aún no conocen todas las formas en que la vida profunda del subsuelo afecta la vida de la superficie y viceversa. Y, por ahora, solo podemos maravillarnos de la naturaleza de los metabolismos que permiten que la vida sobreviva en las condiciones extremadamente empobrecidas y prohibitivas para la vida en la Tierra profunda ".
Entre los muchos enigmas restantes de la vida profunda en la Tierra:
Movimiento: ¿Cómo se extiende la vida profunda, lateralmente a través de grietas en las rocas? ¿Arriba abajo? ¿Cómo puede la vida profunda ser tan similar en Sudáfrica y Seattle, Washington? ¿Tenían orígenes similares y estaban separados por placas tectónicas, por ejemplo? ¿O se mueven las comunidades mismas? ¿Qué papel juegan los grandes eventos geológicos (como la tectónica de placas, los terremotos, la creación de grandes provincias ígneas, los bombardeos de meteoritos) en los movimientos de la vida profunda?
Orígenes: ¿Comenzó la vida en lo profundo de la Tierra (ya sea dentro de la corteza, cerca de respiraderos hidrotermales o en zonas de subducción) y luego emigró hacia el sol? O
 Referencia:
 https://deepcarbon.net/life-deep-earth-totals-15-23-billion-tonnes-carbon

jueves, 25 de octubre de 2018


Para reflexionar
Una investigación en bacterias extraídas de sedimentos profundos del fondo oceánico muestra la extremada lentitud de su metabolismo demorando cientos de años para reproducirse. Tal vez esa es la regla en el universo donde la energía no siempre está fácilmente disponible (como sucede en general en la Tierra).

Bacterias con metabolismo extremadamente lento enterradas en el fondo del océano

Cuando las algas mueren, se desplazan hacia el fondo del océano, y sus cuerpos se vuelven uno con la suciedad del fondo marino. Esta lluvia de algas cae constantemente y, a medida que las capas de materia orgánica se acumulan con el paso de los años, entierran las bacterias que crecen en el fondo marino. Subsumido en el fango, muchas bacterias mueren. Pero algunos, unos pocos resistentes, sobreviven. Y cuando los geoquímicos y biólogos profundizan en el lecho marino y levantan largos núcleos negros que reflejan cientos o miles de años de acumulación, encuentran a los descendientes vivos de los internados bacterianos originales.

¿Cómo logran los microbios mantenerse vivos allí abajo? Como nada entra o sale, deben tener alguna forma de subsistir con los restos de algas que enterraron a sus antepasados ​​hace tanto tiempo. Entonces, una respuesta podría ser que han evolucionado para hacer un uso más eficiente de los recursos extremadamente escasos con los que están enterrados.
Pero un estudio reciente en PNAS sugiere que algo muy diferente es cierto: las bacterias que viven a la deriva, con menos de 5,000 años de algas muertas, apenas parecen estar evolucionando. De hecho, se están reproduciendo de manera extremadamente lenta, por lo que cualquier adaptación, si está sucediendo, no tendría muchas posibilidades de tener efecto. Aunque muchas bacterias se duplican en cantidad cada pocos minutos, los cálculos de estos investigadores sugieren que en las bacterias de los fondos marinos, lleva cientos de años.
Se cree que las bacterias de los fondos marinos son un grupo peculiar, dice Kasper Kjeldsen, un bioquímico de la Universidad de Aarhus en Dinamarca. Debes serlo para vivir como ellos: "Hay muy poca energía disponible cuando tienes que seguir comiendo en la misma lonchera" durante miles de años, dice. "Es uno de los entornos con más energía limitada de nuestro planeta". Pero ha sido difícil estudiar la biología de los microbios, ya que no crecerán en una placa de Petri. En cambio, los investigadores han tenido que desarrollar técnicas para inferir cosas sobre ellos a partir de su ADN, que pueden extraer de las columnas de estiércol. Debido a que las diferentes profundidades representan épocas conocidas (la edad del lodo puede ser identificada con la datación por carbono) es posible estudiar el cambio de la bacteria a lo largo del tiempo.
Para ese fin, Kjeldsen y sus colegas extrajeron núcleos de cuatro sitios en la bahía de Aarhus, y tomaron muestras de cinco puntos diferentes a lo largo de la longitud de cada núcleo. Luego secuenciaron el ADN de bacterias individuales de cada punto de tiempo y lo compararon con todos los demás. Descubrieron que las especies de bacterias que viven en las profundidades también existen en la superficie del fondo marino, aunque son relativamente raras entre las poblaciones allí. Eso refuerza la idea de un grupo selecto, más adecuado para los desafíos de ser enterrado vivo, persistiendo después de que los otros mueren.
El equipo también encontró que una vez que los microbios fueron enterrados, su ADN no cambió. "Lo que vimos fue que hay una diversidad genética muy baja con una población que atraviesa la profundidad y el tiempo, en el sedimento", dice Kjeldsen. "Esto nos dice que el cambio evolutivo en el tiempo es muy, muy, muy bajo".
Continúa: “Básicamente significa que las bacterias que se encuentran en la superficie del sedimento son más o menos genéticamente idénticas a las que subsisten bajo la limitación energética extrema en el sedimento profundo del subsuelo. ... Ya poseen esta habilidad desde el principio ".
A continuación, los investigadores monitorearon el metabolismo de las bacterias, utilizando isótopos radioactivos. Podrían estimar cuánto tiempo tomaría, a la tasa observada de convertir los alimentos en energía, que las bacterias creen suficiente biomasa nueva para reproducirse. En los sedimentos de 400 años, la tasa fue de una réplica por año. Más profundo, en la capa de 4,900 años, era del orden de uno por cien años. Este no es el tiempo de generación más largo jamás calculado para las bacterias; incluso más profundo en el lodo, se estima que otros crecen mucho más lentamente, dice Kjeldsen. 1204/5000
Pero estos números encajan con lo que otros grupos han encontrado a esta profundidad.
Las mutaciones a menudo surgen de errores en el ADN cometidos cuando las células se duplican. Y si hay tan poca energía que la replicación ocurra solo muy lentamente, entonces tiene sentido que las mutaciones solo surjan muy raramente, y que si alguna de ellas fuera útil, les tomaría las edades correspondientes para que compitan menos en forma hermanos. Es un mundo que se mueve en cámara lenta, encerrado en gelatina o, más bien, en sedimento.
Aún así, las técnicas que sostienen el documento utilizan ciertas suposiciones, advierte Kjeldsen. Por ejemplo, no está seguro de si las bacterias están formando nuevas células o si solo están usando la energía para repararse a sí mismas.
Podría haber cambios genéticos muy pequeños que la técnica no revela, también.
"Lo que no sabemos", dice, "es cuánto cambio genético se necesita para obtener una ventaja competitiva? Hay un límite a qué tan sutiles son las diferencias genéticas que podemos detectar con nuestro método aquí ”. Estos cambios más pequeños aún podrían ser capaces de hacer una diferencia, de alguna manera, en la capacidad de un microbio para sobrevivir en un entorno con escasez de recursos. "Esto es algo que estamos tratando de abordar ahora", dice.
Por Veronique Greenwood
Ref.
https://www.theatlantic.com/science/archive/2017/04/bacteria-buried-alive/524214/