Los denisovanos son una especie de Homo o una subespecie arcaica de Homo sapiens que se ha descubierto y estudiado recientemente en Asia Central.

El mtDNA de Denisova 3 (Denisova 3 es la muestra fósil mejor conservada) difiere del de los humanos modernos en 385 bases (nucleótidos) de aproximadamente 16.500, mientras que la diferencia entre los humanos modernos y los neandertales es de alrededor de 202 bases. En comparación, la diferencia entre los chimpancés y los humanos modernos es de aproximadamente 1.462 pares de bases de ADNmt. Esto sugirió que el ADNmt de Denisovan divergía del de los humanos modernos y los neandertales hace unos 1.313.500 a 779.300 años; mientras que el ADNmt del neandertal y el humano moderno divergieron hace 618-321.200 años. Krause y sus colegas luego concluyeron que los denisovanos eran descendientes de una migración anterior de H. erectus fuera de África, completamente distinta de los humanos modernos y los neandertales.

Sin embargo, según el ADN nuclear (ADNn) de Denisova 3, que tenía un grado inusual de preservación del ADN con una contaminación de bajo nivel, los denisovanos y los neandertales estaban más estrechamente relacionados entre sí que con los humanos modernos. Utilizando el porcentaje de distancia desde el último ancestro común humano-chimpancé, los denisovanos / neandertales se separaron de los humanos modernos hace unos 804.000 años, y entre sí hace 640.000 años. Usando una tasa de mutación de 1x10−9 o 0.5x10−9 por par de bases (pb) por año, la división Neanderthal / Denisovan ocurrió alrededor de 236-190,000 o 473-381,000 años respectivamente. [22] Usando 1.1x10−8 por generación con una nueva generación cada 29 años, el tiempo es hace 744,000 años. Utilizando 5x10-10 nucleótidos por año, hace 616.000 años. Usando las últimas fechas, la división probablemente ya había ocurrido cuando los homínidos se extendieron por Europa. [23] Se suele considerar que H. heidelbergensis fue el antepasado directo de los denisovanos y los neandertales y, a veces, también de los humanos modernos. Debido a la fuerte divergencia en la anatomía dental, es posible que se hayan dividido antes de que la dentición neandertal característica evolucionara hace unos 300.000 años.